很多人都認為履約保證金和履約保函兩者之間是一個概念，其實是不一樣的。履約保證金由承包方或供貨方直接支付給業主方，可用保兌支票、銀行匯票或現金，履約保證金不得超過合同總金額的10%。而履約保函是指應承包方或供貨方（申請人）的請求，銀行金融機構向業主方（受益人）做出的一種履約保證承諾。如果承包方或供貨方在整個合同期內未能按時、按質、按量完成其所承建的工程，銀行則向業主方支付一筆約占合同總金額5%--10%的款項。所以顧名思義，這兩者從概念上是存在很大卻別的.
除了概念這塊的區別，這兩者還有以下區別。
第一，履約保證金一般是承包方或供貨方直接向業主方支付合同約定數額的現金，到了合同約定的時間之后，承包方或供貨方需要找業主方追款。而在實際業務中，會存在各種原因，追款可能不會很順利，反而造成了承包方或供貨方的被動。
第二，履約保函的辦理手續相對比較繁瑣，而且銀行會依據保函金額和保函期限收取相應的手續費用，這對于承包方或者供貨方來說無疑增加了資金成本。但履約保函中會根據合同條款或雙方約定以及銀行的要求，明確保函有效期限（具體至某一天），到了這一天，這筆錢就從銀行自動解凍，并不需要業買方的同意與否。
第三，履約保函一方面盤活資金，有利于減輕承包方或供貨方的資金壓力，另一方面履約保函代替履約保證金，有利于規范經濟活動資金流轉秩序，加強經濟活動信用程度，提升工程建設單位及供貨方單位的整體形象。